将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！ 这时，纽约市中发生一连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！ 神龟们又处于备战状态了！他们再次联合起来，准备向黑暗势力出击！
演员：加里·奥德曼 阿曼达·塞弗里德 莉莉·柯林斯 查尔斯·丹斯 艾利斯·霍华德 汤姆·派福瑞 塔彭丝·米德尔顿 汤姆·伯克 杰米·麦克沙恩 莱文·兰宾 托比·莱昂纳德·摩尔 山姆·特劳顿 约瑟夫·克罗斯 艾维·约斯特 亚当·沙皮罗 费迪南德·金斯利 保罗·福克斯 娜塔莉·丹尼斯·斯皮尔 里克·帕斯夸隆 保罗·卡拉夫特斯 克里斯蒂安·普伦蒂斯 约翰·李·艾姆斯 金斯顿·凡尔内斯 克莱格·罗伯特·扬 贾可琳·贝瑟尼 卡米尔·蒙哥马利 克雷格·韦茨巴赫尔 乔安妮·汤姆森 达娜·林恩·拜伦 斯图瓦特·斯科尔顿 克里斯
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演员：Anna Bolk Wolfgang Michael 安格拉·夏娜莱克 迈克尔·梅尔坦斯 Margit Bendokat Andreas Herder Jirka Bethke Lukas Confurius Katharina Linder Johannes Schütz
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